IJV | 組織模型設定 July, 2021 - Revised
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硬體設定
i. 光源基本參數與模擬
- 實體圖
- 規格
- 尺吋
- Holder
- 邊長: 28 mm
- 中央出光孔半徑: 5 mm
- Holder
- 折射率
- Holder 材質為 PLA,680-810nm 下的折射率如下圖。資料來源: Optical Properties of Polylactides。
- 尺吋
- MCX 之 Illumination pattern 模擬方式
以下方之 pattern 進行模擬(上學期間修改 mcx source code 之結果)
簡單驗證流程回顧(6月至7月初之進度)
- 目標:mcx 模擬之 pattern 需與實驗拍攝之 pattern 一致 (符合真實情況)
- Pattern 比對之結果
- 方法一:畫一條穿過影像中心點的直線,觀察模擬結果與實驗結果在此一直線上的變化趨勢是否一致。
One of previous results ↓
- 方法二:觀察模擬結果與實驗結果的 average of gray value over the same radial distance 是否一致。
One of previous results ↓
- 方法一:畫一條穿過影像中心點的直線,觀察模擬結果與實驗結果在此一直線上的變化趨勢是否一致。
- 結論 在以上的兩個比對方法中,mcx 模擬之 pattern 與實驗拍攝之 pattern 皆具有一定程度之一致性,因此往後將以此 pattern 代表真實情況進行模擬。
ii. 偵測器基本參數與模擬
- 實體圖
- 規格
- 尺吋
- Holder
- 長邊: 14.06 mm
- 短邊: 12.13 mm
- Prism
- 邊長 5 mm 之等腰直角三角形
- Holder
- 折射率
- Holder 材質亦為 PLA,因此折射率與光源之 Holder 相同。
- Prism 稜鏡型號為 → PS909, THORLAB,與胤甫、哲皓使用的型號相同。材質為 N-BK7。折射率計算公式(Sellmeier Equation)如下圖。資料來自於來源。 上述之公式的 unit of λ 為 μm。而另一個可供參考之折射率資料位於此網站 (given by THORLAB Tech Support)。因此,透過 Sellmeier Equation 的計算,我們可得 680-810nm 下的折射率如下圖
- 尺吋
- 光纖 full acceptance angle 之計算
- 數值孔徑, NA 根據老師提供的資料,我們所使用的光纖NA為==0.22==。
- 計算流程 光纖的 full acceptance angle 計算公式為 2 x sin^-1^(NA/n_prism),代入不同波長下的 n_prism,可見下圖的涵蓋範圍。
- 稜鏡尺吋的適合度驗算
- MCX 之模擬方式:
於 MCX 內,我們以
將 Prism 與 PLA 皆視為組織的方式進行模擬
,避開於 source code 中調整 detector 高度的問題。MCX 之模擬示意圖如下。 對照之真實情況示意圖如下。(並未 follow 真正擺設之方向)
iii. 探頭量測之完整擺設
- 探頭擺設方向:位於 ijv 正上方、與 ijv 平行
- 局部示意圖,聚焦於硬體的擺設,探頭下方僅含一層組織。(利用 MCX 作者近期開發的 MCX Cloud 中的 Preview 功能繪製)
簡易三視圖 ↓
- 俯視圖
- 前視圖
- 側視圖
- 整體示意圖,探頭下方含完整組織。
幾何參數設定
-
昕原
- Upper neck
- Middle neck
- Lower neck
-
逸翔
- Upper neck
- Middle neck
- Lower neck
光學參數設定
- Background layer
- 1st layer
- 2nd layer
相關問題
1. MCX 細節參數設定
- Boundary reflect → No
2. 模型大小 (長、寬、高)
3. detector 可以有 2 個?
4. 實驗發現稜鏡影響穩定度
5. 靜脈半徑計算 → (長邊+短邊)/2
後續
- 測試模型多大才不會影響 reflectance
- 測試多個 sds 會不會影響 reflectance、計算反射率差異